ＡＶＩファイルの読込み中に下記のようなエラーメッセージが出て、処理が中断してしまいます。
　モジュール'MGen.exe'のアドレスXXXXXXXXでアドレスXXXXXXXXに対する読み込み違反がおきました。

　読込み対象のＡＶＩファイルがハードメーカー独自の圧縮（コーデック）モジュールを使用して作成されていた場合に起こる現象です。
　この場合は、対応する圧縮（コーデック）モジュールをインストールするか、ＡＶＩファイルを作成したマシン上でムービージェネレータを実行する必要があります。

　コマンドライン指定で動画を自動作成することは可能でしょうか？

　ムービージェネレータはウィンドウズ形式でのみ動作します。
　ＤＯＳ窓上で動作するバージョンは用意しておりません。